More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3824 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12389  amidase  73.73 
 
 		 484 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  77.69 
 
 		 504 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2712  amidase  84.28 
 
 		 504 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.917401  normal  0.488259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  77.69 
 
 		 504 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  77.69 
 
 		 504 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  100 
 
 		 505 aa  1006    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  57.14 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  54.95 
 
 		 484 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  53.52 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  53.86 
 
 		 472 aa  359  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  45.47 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  41.09 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  36.89 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  36.53 
 
 		 467 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3429  Amidase  42.67 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  38.99 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  39.53 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.77 
 
 		 491 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.3 
 
 		 475 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  35.13 
 
 		 465 aa  186  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  36.5 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  33.54 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  37.77 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  34 
 
 		 464 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.57 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  36.04 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  32.29 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  37.07 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  31.66 
 
 		 503 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0864  amidase  37.31 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241071  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.57 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  37.17 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.9 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  34.9 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.33 
 
 		 485 aa  176  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  33.91 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.11 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.79 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  32.78 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.59 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  30.35 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.48 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  33.19 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  40.61 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  38.08 
 
 		 488 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.19 
 
 		 480 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.39 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.26 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  36.17 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  37.65 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  34.05 
 
 		 473 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.63 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.78 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  31.15 
 
 		 486 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.84 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.25 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.13 
 
 		 486 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.63 
 
 		 486 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  32.76 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  37.2 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.78 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  34.2 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.71 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  32.64 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.29 
 
 		 489 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.2 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.51 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.95 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  32.84 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.87 
 
 		 486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  36.29 
 
 		 486 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.13 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.33 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  36.38 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.66 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.84 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  33.33 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.63 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.93 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2037  Amidase  37.12 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  33.27 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  33.62 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  33.61 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  33.11 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.13 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.91 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.3 
 
 		 484 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.06 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.87 
 
 		 486 aa  163  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 		 483 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  31.81 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  30.5 
 
 		 491 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  31.08 
 
 		 473 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12630  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.73 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.38 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  36.78 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  34.22 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.98 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  32.1 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>