More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1602 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1602  amidase  100 
 
 		 476 aa  935    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  56.93 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  58.1 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  56 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  52.94 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  51.15 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  52.13 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  52.74 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  50.21 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  50.21 
 
 		 488 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  52.39 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  43.79 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  42.2 
 
 		 495 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  41.15 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  39.57 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  39.78 
 
 		 467 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  42.11 
 
 		 475 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  43.29 
 
 		 495 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  41.79 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  43.27 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.52 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  42.62 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  41.82 
 
 		 469 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  40.98 
 
 		 466 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  42.83 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  37.7 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  42.57 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  41.97 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.52 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  41.77 
 
 		 495 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  36.87 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.11 
 
 		 484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  37.91 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  39.29 
 
 		 474 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  42.77 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  35.76 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  38.59 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  38.63 
 
 		 481 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  37.75 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.09 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  38.26 
 
 		 493 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  39.96 
 
 		 483 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.3 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  40.12 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  38.66 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.57 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  37.65 
 
 		 499 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  35.38 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  41.38 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  38.38 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.44 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.91 
 
 		 485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  40.87 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.75 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  36.29 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.71 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  37.53 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.67 
 
 		 479 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  34.43 
 
 		 492 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  36.29 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.4 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3429  Amidase  42.24 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.68 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.38 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  42.92 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  37.82 
 
 		 482 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  39.04 
 
 		 489 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  39.04 
 
 		 489 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  39.04 
 
 		 489 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  36.62 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  36.59 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  33.9 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  40.52 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.2 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  33.69 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.3 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  36.11 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  35.95 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.15 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  36.13 
 
 		 501 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.65 
 
 		 495 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.18 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.59 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  42.18 
 
 		 472 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  39.12 
 
 		 484 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  36.48 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.05 
 
 		 492 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  35.4 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  36.92 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  34.86 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  36.29 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.47 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  35.26 
 
 		 494 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  40.98 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  36.96 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.34 
 
 		 466 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  37.4 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>