More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2163 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2163  amidase  100 
 
 		 531 aa  1088    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  42.77 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  42.47 
 
 		 476 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  39.96 
 
 		 501 aa  316  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  42.15 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.18 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.87 
 
 		 473 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  38.07 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  41.3 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  41.3 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  41.3 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.02 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.71 
 
 		 484 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  40.79 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.03 
 
 		 476 aa  283  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.29 
 
 		 493 aa  281  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  39.05 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  37.25 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  38.88 
 
 		 475 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  38.96 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  38.7 
 
 		 488 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  39.16 
 
 		 495 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  38.77 
 
 		 519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  37.95 
 
 		 495 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  38 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.84 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  37.95 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.07 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  37.14 
 
 		 481 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.08 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.04 
 
 		 476 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.13 
 
 		 508 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  36.87 
 
 		 489 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  36.87 
 
 		 489 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.51 
 
 		 483 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  35.62 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  35.69 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  38.33 
 
 		 474 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.7 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.17 
 
 		 498 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  36.49 
 
 		 489 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.72 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  38.53 
 
 		 490 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.65 
 
 		 496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.8 
 
 		 496 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.8 
 
 		 494 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.8 
 
 		 494 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.8 
 
 		 494 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  37.6 
 
 		 517 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  37.05 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  37.6 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  34.94 
 
 		 472 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  37.8 
 
 		 521 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  36.46 
 
 		 476 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  35.5 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  38.1 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  37.72 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  36.7 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  34.03 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  36.47 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  36.02 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  37 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  33.75 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  37.89 
 
 		 483 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  35.09 
 
 		 495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.77 
 
 		 522 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  33.33 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  35.49 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  36.81 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.11 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  37.78 
 
 		 496 aa  220  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  33.82 
 
 		 502 aa  220  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  34.16 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.97 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  35.32 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  36.63 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  36.36 
 
 		 486 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  36.42 
 
 		 489 aa  213  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  36.42 
 
 		 489 aa  213  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.66 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  37.35 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.57 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  36.79 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  36.8 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  31.57 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  33.13 
 
 		 475 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  32.91 
 
 		 490 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  31.57 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  36.55 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  36.71 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  36.71 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  38.38 
 
 		 495 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  36.71 
 
 		 492 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  34.34 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.54 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  32.11 
 
 		 488 aa  196  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.3 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  36.2 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  32.54 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.33 
 
 		 495 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>