More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1016 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1016  amidase  100 
 
 		 489 aa  976    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  81.72 
 
 		 489 aa  781    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  81.52 
 
 		 489 aa  779    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  81.52 
 
 		 489 aa  779    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  79.88 
 
 		 490 aa  755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  62.58 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  59.43 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  56.97 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  55.53 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  51.12 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  48.67 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  47.22 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  45.51 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  47.64 
 
 		 509 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  43.58 
 
 		 519 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  42.51 
 
 		 503 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  46.12 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  44.09 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  42.77 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  46.59 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  44.33 
 
 		 499 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  46.99 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  42.86 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  43.06 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  43.7 
 
 		 474 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  43 
 
 		 476 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  42.31 
 
 		 474 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.92 
 
 		 473 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.3 
 
 		 496 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  42.3 
 
 		 517 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  42.19 
 
 		 492 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.3 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.3 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.3 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.3 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  41.39 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  42.3 
 
 		 521 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  41.78 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  41.48 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  37.6 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  41.06 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  40.08 
 
 		 497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  40.7 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  39.21 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.86 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  40.41 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  42.8 
 
 		 492 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.07 
 
 		 492 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.95 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  40.61 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  42.39 
 
 		 492 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  42.39 
 
 		 492 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  43.79 
 
 		 489 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  43.79 
 
 		 489 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  42.6 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  41.39 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  41.58 
 
 		 504 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  43.79 
 
 		 489 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  36.49 
 
 		 531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  40.81 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  37.9 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  36.53 
 
 		 481 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.62 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  38.38 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  36.65 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.37 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  38.38 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  41.3 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  35.98 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  38.2 
 
 		 495 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  37.86 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  37.86 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  33.2 
 
 		 486 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  37.2 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  37.2 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  37.2 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  36.38 
 
 		 470 aa  229  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  37.65 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  35.98 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.77 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.6 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  38.49 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  37.5 
 
 		 474 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  40.14 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  34.97 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  36.78 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  38.6 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.52 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  35.56 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  35.14 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  37.42 
 
 		 494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  31.99 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  36.51 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  36.57 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  36.4 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  34.41 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  40.52 
 
 		 476 aa  202  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  38.79 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  32.48 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>