More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0390 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0110  amidase  75.4 
 
 		 504 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  92.9 
 
 		 522 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  100 
 
 		 506 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  64.83 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.48 
 
 		 496 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  65.48 
 
 		 517 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.29 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.23 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.23 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.23 
 
 		 494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  65.29 
 
 		 521 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  64.75 
 
 		 492 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  65.54 
 
 		 492 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  64.75 
 
 		 492 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  66.34 
 
 		 492 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  65.94 
 
 		 492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  65.94 
 
 		 492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  64.36 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  42.21 
 
 		 519 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.09 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  42.74 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  39.5 
 
 		 503 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  41.04 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  41.85 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  44.25 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  44.64 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  41.65 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  41.65 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  42.6 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  43.25 
 
 		 492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  39.73 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  41.11 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  41.37 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  41.06 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  42.01 
 
 		 502 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  40.43 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.6 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  40.24 
 
 		 474 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  43.25 
 
 		 495 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  40.39 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  40.36 
 
 		 481 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  40.39 
 
 		 490 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  38.94 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  38.68 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  43.03 
 
 		 496 aa  267  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  39.6 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  40.12 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  38.48 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  38.6 
 
 		 480 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  38.6 
 
 		 480 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.6 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  40.2 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  37.43 
 
 		 495 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.05 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  36.76 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  37.82 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  39.68 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.94 
 
 		 508 aa  249  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  39.01 
 
 		 479 aa  249  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  38.45 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  39.56 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.59 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  39.12 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.31 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  36.88 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  37.89 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.08 
 
 		 501 aa  233  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  36.84 
 
 		 483 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  35.84 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.24 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  35.05 
 
 		 476 aa  223  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  40.64 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  40.64 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  40.64 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  37.4 
 
 		 481 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  36.29 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  36.05 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.1 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  34.15 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  33.74 
 
 		 467 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  32.5 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  34.52 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  33.93 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  35.7 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  35.7 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.13 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  31.67 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  35.7 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  37.25 
 
 		 477 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  33.07 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  32.94 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  36.85 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  33.13 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  35.46 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  37.58 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  36.45 
 
 		 486 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.32 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  34.39 
 
 		 476 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.92 
 
 		 472 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  33.46 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>