More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1611 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1611  amidase  100 
 
 
486 aa  1006    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  48.33 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  41.45 
 
 
499 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  39.06 
 
 
508 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  37.74 
 
 
495 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  35.45 
 
 
501 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.63 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  35.82 
 
 
680 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  35.36 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  34.71 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  35.31 
 
 
499 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  34.99 
 
 
503 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0866  cell wall anchor domain-containing protein  35.33 
 
 
637 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.373011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  33.75 
 
 
531 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  33.2 
 
 
489 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  32.85 
 
 
489 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  32.64 
 
 
489 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  32.64 
 
 
489 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  34.06 
 
 
493 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0612  Amidase  32.37 
 
 
529 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  35.05 
 
 
519 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.76 
 
 
492 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  32.45 
 
 
490 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  36.76 
 
 
501 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.85 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  32.69 
 
 
499 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  32.32 
 
 
460 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  33.05 
 
 
496 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  31.94 
 
 
475 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  32.33 
 
 
460 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  32.01 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  32.03 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  31.36 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  31.56 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  31.95 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  31.61 
 
 
474 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  33.54 
 
 
504 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  30.58 
 
 
476 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  30.17 
 
 
481 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  29.68 
 
 
488 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.64 
 
 
496 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  32.32 
 
 
522 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  31.67 
 
 
492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.01 
 
 
496 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  31.81 
 
 
521 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.01 
 
 
494 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.01 
 
 
494 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.01 
 
 
494 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  31.88 
 
 
492 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  31.39 
 
 
517 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.01 
 
 
496 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  32.44 
 
 
476 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  32.31 
 
 
483 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  29.01 
 
 
484 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  33.33 
 
 
474 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  32.72 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  28.57 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  31.21 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  28.96 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  28.57 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  31.05 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  28.57 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  32.24 
 
 
492 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  31.46 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  28.72 
 
 
483 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  28.76 
 
 
473 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  31.62 
 
 
476 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  31.7 
 
 
495 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  31.21 
 
 
489 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  29.18 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  29.16 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  27.5 
 
 
492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  30.47 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  30.83 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  33.47 
 
 
502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  30.85 
 
 
496 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  31.24 
 
 
500 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  28.27 
 
 
470 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  28.27 
 
 
470 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  28.27 
 
 
470 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.81 
 
 
477 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  31.68 
 
 
492 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  31.68 
 
 
492 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  31.16 
 
 
495 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  28.09 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  31.68 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  29.19 
 
 
479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  28.4 
 
 
492 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  30.42 
 
 
476 aa  163  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  26.67 
 
 
491 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  28.86 
 
 
473 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.93 
 
 
469 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  28.36 
 
 
490 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  29.27 
 
 
476 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  30.37 
 
 
492 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  28.66 
 
 
469 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  29.67 
 
 
477 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  28.6 
 
 
481 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  27.09 
 
 
472 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  28.48 
 
 
470 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>