More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4481 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  100 
 
 		 494 aa  998    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  58.96 
 
 		 474 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  47.95 
 
 		 503 aa  356  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  42.98 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  43.6 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  42.23 
 
 		 475 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  40.22 
 
 		 470 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.35 
 
 		 496 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.35 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.35 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.35 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  42.98 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  43.83 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  43.62 
 
 		 496 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  43.62 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  41.57 
 
 		 506 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  39.39 
 
 		 479 aa  269  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  41.19 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  40.93 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  41.12 
 
 		 474 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  39.22 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  40.95 
 
 		 492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  39.87 
 
 		 474 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  39.39 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  39.39 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.4 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  38.83 
 
 		 501 aa  257  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  39.39 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  40.08 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.19 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  40.52 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  40.33 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  38.73 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  38.53 
 
 		 468 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  40 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.63 
 
 		 493 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  40.73 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  38.14 
 
 		 531 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  36.34 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  38.22 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  39.29 
 
 		 481 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  42.42 
 
 		 493 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  40.12 
 
 		 500 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  40.97 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  41.13 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  38.45 
 
 		 508 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  38.04 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  40.67 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  40.95 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  40.95 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  37.13 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  36.59 
 
 		 519 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  37.94 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  40.95 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  41.27 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.29 
 
 		 493 aa  230  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  40.95 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.85 
 
 		 489 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  38.06 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  38.06 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  36.29 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  39.15 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.59 
 
 		 473 aa  227  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  38.35 
 
 		 473 aa  226  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  37.5 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  40.28 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  37.63 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  37.58 
 
 		 491 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.79 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  36.31 
 
 		 476 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  37.42 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  36.57 
 
 		 490 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  41.15 
 
 		 475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.5 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  37.5 
 
 		 479 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3114  Amidase  41.48 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0666  amidase  37.64 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341126  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  37.37 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  37.21 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  37.21 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  37.21 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  36.02 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  37.29 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  37.86 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  37.32 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  36.52 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.19 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.97 
 
 		 485 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  35.55 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  37.26 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  33.06 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  34.22 
 
 		 489 aa  191  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  32.42 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.01 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.81 
 
 		 498 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  36.49 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  33.54 
 
 		 491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  37.5 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  37.37 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  33.56 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>