More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3007 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3114  Amidase  96.5 
 
 
493 aa  740    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  100 
 
 
495 aa  941    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  82.83 
 
 
493 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  48.06 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  44.14 
 
 
474 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  42.83 
 
 
503 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  42.22 
 
 
494 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  38.25 
 
 
531 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  43.31 
 
 
474 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  40.76 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  39.62 
 
 
482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  37.75 
 
 
503 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  41.97 
 
 
495 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  39.12 
 
 
476 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  42.37 
 
 
495 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  38.92 
 
 
474 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40 
 
 
483 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  40.58 
 
 
501 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  41.35 
 
 
500 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  39.96 
 
 
493 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  39.09 
 
 
474 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.71 
 
 
473 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.53 
 
 
470 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  39.45 
 
 
509 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  38.57 
 
 
495 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  37.85 
 
 
501 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  39.88 
 
 
489 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  40.4 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  38.7 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  38.7 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.7 
 
 
480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  39.53 
 
 
475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  36.21 
 
 
479 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  38.02 
 
 
489 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  40 
 
 
522 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  36.95 
 
 
499 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.79 
 
 
493 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.28 
 
 
496 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.82 
 
 
489 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.82 
 
 
489 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.39 
 
 
476 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  34.48 
 
 
470 aa  206  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  36.69 
 
 
475 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  37.71 
 
 
491 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.17 
 
 
483 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  37.74 
 
 
468 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  41.5 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  39.11 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  35.61 
 
 
488 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.08 
 
 
472 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  35.47 
 
 
519 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  42.01 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  40.45 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  40.32 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.77 
 
 
476 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  37.22 
 
 
508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  37.47 
 
 
484 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  39.06 
 
 
506 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  40.63 
 
 
476 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  36.69 
 
 
477 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  36.63 
 
 
468 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  39.27 
 
 
493 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.7 
 
 
496 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  41 
 
 
485 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  37.77 
 
 
517 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  39.79 
 
 
476 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.7 
 
 
494 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.7 
 
 
494 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.7 
 
 
494 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.8 
 
 
496 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  37.8 
 
 
521 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.04 
 
 
492 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  41.24 
 
 
495 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  35.26 
 
 
481 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  38.16 
 
 
477 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.68 
 
 
495 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  35.5 
 
 
492 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  41.21 
 
 
492 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  41.28 
 
 
492 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  36.31 
 
 
476 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  36.36 
 
 
470 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  36.36 
 
 
470 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.27 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  36.36 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.9 
 
 
498 aa  183  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0666  amidase  37.55 
 
 
466 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341126  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.71 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  34.81 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  37.5 
 
 
486 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  39.96 
 
 
496 aa  180  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  37.32 
 
 
481 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  37.75 
 
 
476 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  39.38 
 
 
476 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  32.98 
 
 
472 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  40.04 
 
 
492 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  41.55 
 
 
492 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  36.44 
 
 
476 aa  177  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  39.64 
 
 
492 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  39.64 
 
 
492 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  36.98 
 
 
471 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>