More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2037 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2037  Amidase  100 
 
 		 470 aa  889    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  52.78 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0864  amidase  52.18 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241071  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  47.68 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  46.78 
 
 		 461 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0557  Amidase  46.71 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2712  amidase  38.95 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.917401  normal  0.488259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  34.63 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  39.73 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  39.73 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  39.73 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1500  Amidase  39.65 
 
 		 464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.902892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.51 
 
 		 477 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  34.77 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  36.81 
 
 		 505 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  38.03 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  38.65 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  36.78 
 
 		 485 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  37.04 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  34.51 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  34.51 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  37.42 
 
 		 476 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3429  Amidase  41.59 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.24 
 
 		 495 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  33.12 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  35.84 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  38.49 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  38.36 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  36.1 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.56 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  39.87 
 
 		 472 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  37.63 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34.84 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  37.6 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  30.61 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  33.84 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  32.08 
 
 		 479 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.12 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  38 
 
 		 476 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  33.76 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  32.83 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  37.66 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.68 
 
 		 494 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  33.88 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  33.19 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.97 
 
 		 508 aa  153  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  31.21 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  33.94 
 
 		 501 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  37.13 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  32.99 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  38.13 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  38.02 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.62 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.41 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  33.12 
 
 		 502 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  35.98 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  33.33 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  33.89 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.65 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  33.89 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  34.04 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  33.33 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.9 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  30.72 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  33.26 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  30.36 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.68 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  35.29 
 
 		 489 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.61 
 
 		 496 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.29 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.29 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  34.56 
 
 		 495 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.75 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  33.69 
 
 		 499 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  38.18 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  35.76 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  31.49 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.26 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.75 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  35.56 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  32.77 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  31.55 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  31.55 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  31.55 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.05 
 
 		 476 aa  144  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  36.2 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  35.82 
 
 		 476 aa  143  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  34.88 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  29.89 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  34.57 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  35.39 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.12 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  33.33 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  30.26 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  30.25 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  31.51 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.08 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.38 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  30.25 
 
 		 494 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>