More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4870 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4870  Amidase  100 
 
 		 473 aa  941    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  51.28 
 
 		 477 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  51.28 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  52.37 
 
 		 475 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  50.96 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  52.58 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  52.32 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  51.18 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  50.74 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  53.83 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  47.94 
 
 		 490 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  47.94 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  45.63 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  44.35 
 
 		 496 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  42.09 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  42.58 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  42.26 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  42.26 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  42.26 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  41.47 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  41.68 
 
 		 494 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  41.65 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  41.97 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  42.6 
 
 		 484 aa  309  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  42.6 
 
 		 484 aa  309  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  42.6 
 
 		 484 aa  309  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  42.6 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  42.6 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  42.6 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  43.07 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  41.77 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  42.42 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  40.94 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  41.95 
 
 		 485 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  41.26 
 
 		 485 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  40.72 
 
 		 491 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  43.2 
 
 		 482 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  40.38 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  43.19 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  41.11 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  42.17 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  44.18 
 
 		 521 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  42.92 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  40.9 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  40.9 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  45.53 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  44.17 
 
 		 477 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  42.61 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  41.09 
 
 		 481 aa  279  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  39.7 
 
 		 556 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  40.65 
 
 		 494 aa  272  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  36.4 
 
 		 495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  40.91 
 
 		 473 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  39.25 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  39.44 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  38.93 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  41.4 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  39.67 
 
 		 486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  39.91 
 
 		 480 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  39.29 
 
 		 492 aa  256  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  37.7 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  37.97 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  38.27 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  39.23 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  38.03 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  37.22 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  38.6 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  37.44 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  38.96 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  38.06 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.55 
 
 		 495 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  38.96 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  39.03 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  38.6 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.18 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  37.25 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  36.17 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.57 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.45 
 
 		 486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.36 
 
 		 491 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.65 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  38.7 
 
 		 463 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.4 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  39.02 
 
 		 504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.54 
 
 		 485 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  36.44 
 
 		 471 aa  212  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.07 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  36.6 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.27 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.68 
 
 		 469 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  36.95 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.84 
 
 		 486 aa  206  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.4 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  38.59 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  33.26 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.73 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.42 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1621  amidase  37.45 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>