More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4073 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4073  amidase  100 
 
 		 556 aa  1129    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  63.07 
 
 		 494 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  73.35 
 
 		 505 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  63.07 
 
 		 494 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  63.75 
 
 		 494 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  63.33 
 
 		 494 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  63.12 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  63.12 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  63.12 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  64.63 
 
 		 484 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  64.42 
 
 		 497 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  64.42 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  64.42 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  64.69 
 
 		 497 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  64.42 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  64.42 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  64 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  58.42 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  58.35 
 
 		 485 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  57.29 
 
 		 494 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  58.33 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  58.18 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  56.29 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  56.96 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  55.32 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  55.74 
 
 		 521 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  50.43 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  50.64 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  50 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  51.49 
 
 		 486 aa  432  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  48.36 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  51.48 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  48.33 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  49.59 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  50.43 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  45.3 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  45.55 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  46.19 
 
 		 475 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  44.98 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  45.97 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  45.69 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  45.77 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  43.22 
 
 		 463 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  39.87 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.34 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  40.86 
 
 		 490 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  40.43 
 
 		 490 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  41.98 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  39.92 
 
 		 473 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  40.49 
 
 		 477 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  37.91 
 
 		 487 aa  267  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  41.63 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  38.06 
 
 		 473 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  38.24 
 
 		 477 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  37.86 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  35.84 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  35.98 
 
 		 482 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  37.42 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.31 
 
 		 495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.08 
 
 		 473 aa  243  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.6 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  36.42 
 
 		 492 aa  242  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.01 
 
 		 475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  37.55 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  37.69 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  37.14 
 
 		 516 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  36.93 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  34.96 
 
 		 507 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  37.02 
 
 		 506 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  35.12 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  35.03 
 
 		 507 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  35.85 
 
 		 522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  34.5 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  36.44 
 
 		 507 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  36.88 
 
 		 508 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.09 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.57 
 
 		 458 aa  204  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  32.84 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.95 
 
 		 486 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.42 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.69 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.1 
 
 		 469 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  34.62 
 
 		 469 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  33.33 
 
 		 499 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.94 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  34.62 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  33.26 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.89 
 
 		 463 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  34.77 
 
 		 469 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.21 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.43 
 
 		 485 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  32.91 
 
 		 483 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.39 
 
 		 489 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.83 
 
 		 471 aa  187  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.96 
 
 		 483 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.22 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  32.53 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0177  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.15 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.979626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  31.18 
 
 		 471 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  34.71 
 
 		 468 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>