More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3120 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3120  amidase  100 
 
 		 521 aa  1041    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  59.37 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  59.01 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  57.17 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  58.75 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  55.65 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  57.81 
 
 		 485 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  55.53 
 
 		 494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  58.21 
 
 		 485 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  55.32 
 
 		 494 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  55.06 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  55.06 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  54.17 
 
 		 494 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  55.06 
 
 		 494 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  57.58 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  57.58 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  55.88 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  53.1 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  53.15 
 
 		 494 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  54.41 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  56.68 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  55.23 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  52.99 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  54.32 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  54.32 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  54.32 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  54.32 
 
 		 546 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  54.18 
 
 		 497 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  54.32 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  54.53 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  54.32 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  52.93 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  52.64 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  50.84 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  54.99 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  47.65 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  47.57 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  45.96 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  46.67 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  44.3 
 
 		 472 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  46.04 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  48.8 
 
 		 459 aa  355  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  46.88 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  47.39 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  45.04 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  43.95 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  44.35 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  41.6 
 
 		 487 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  44.71 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  44.54 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  45.11 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  37.53 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  38.12 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  38.38 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  39.45 
 
 		 473 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  39.75 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  38.35 
 
 		 480 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  38.45 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  38.5 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  36.48 
 
 		 482 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  38.66 
 
 		 522 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  36.48 
 
 		 507 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  36 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  39.78 
 
 		 498 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  37.71 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  37.71 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  38.89 
 
 		 458 aa  238  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  35.38 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  35.31 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  38.82 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  38.22 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.45 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  37.42 
 
 		 507 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  37.01 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  36.74 
 
 		 507 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  32.63 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  34.97 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.56 
 
 		 483 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.62 
 
 		 485 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.27 
 
 		 469 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.1 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.03 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.19 
 
 		 475 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.07 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  31.57 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.48 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  34.32 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.35 
 
 		 470 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.98 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.87 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  34.63 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.11 
 
 		 485 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.53 
 
 		 495 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  35.17 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  34.42 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.96 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  33.26 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  33.69 
 
 		 469 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  34.24 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.4 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>