More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2260 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  93.89 
 
 		 507 aa  956    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  100 
 
 		 507 aa  1034    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  66.19 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  64.69 
 
 		 516 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  64.3 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  64.26 
 
 		 507 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  64.03 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  63.75 
 
 		 522 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  63.73 
 
 		 506 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  63.86 
 
 		 507 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  63.1 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  49.04 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  50.72 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  49.16 
 
 		 498 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  43.25 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  39.39 
 
 		 477 aa  336  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  43.14 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  40.85 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  38.31 
 
 		 472 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  40.31 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  39.96 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  44.3 
 
 		 472 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  42.36 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  40.13 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  41.87 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  40.04 
 
 		 477 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.96 
 
 		 479 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  40.8 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  37.2 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.79 
 
 		 480 aa  263  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  38.25 
 
 		 494 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  37.04 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  37.58 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  37.58 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  40.17 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  37.58 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  36.64 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  38.58 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  37.17 
 
 		 494 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  37.71 
 
 		 494 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  38.93 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  36.58 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  37.53 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  38 
 
 		 494 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  38.79 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  38.11 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  35.62 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  37.07 
 
 		 487 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.42 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  35.42 
 
 		 492 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  36.96 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  38.76 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.48 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  35.74 
 
 		 480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.22 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  36.5 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  35.17 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  36.83 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  36.5 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  36.6 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  35.81 
 
 		 505 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  35.65 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  36.58 
 
 		 497 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  33.26 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  35.76 
 
 		 469 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.78 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  32.55 
 
 		 473 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  34.61 
 
 		 556 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  34.12 
 
 		 475 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.56 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  34.67 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.1 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.56 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  35.59 
 
 		 459 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.12 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.12 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  35.1 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  35.1 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  35.1 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  35.1 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  35.1 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  35.1 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.33 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  35.1 
 
 		 484 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.54 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  31.63 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  34.87 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  32.91 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  34.13 
 
 		 491 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  34.93 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  33.83 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  33.48 
 
 		 467 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.4 
 
 		 487 aa  190  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.75 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.45 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.75 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  34.09 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  29.36 
 
 		 486 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.56 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.96 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>