More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2248 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1658  amidase  75.25 
 
 		 507 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  83.27 
 
 		 522 aa  812    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  100 
 
 		 516 aa  1043    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  77.48 
 
 		 509 aa  756    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  70.99 
 
 		 508 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  76.27 
 
 		 506 aa  704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  99.22 
 
 		 516 aa  1038    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  73.02 
 
 		 507 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  64.3 
 
 		 507 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  64.1 
 
 		 507 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  63.08 
 
 		 535 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  50.62 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  47.27 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  49.18 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  43.3 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  39.67 
 
 		 477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  40 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  40.18 
 
 		 472 aa  301  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  41.63 
 
 		 463 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  40 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  39.23 
 
 		 472 aa  293  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  39.65 
 
 		 477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  40.74 
 
 		 477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  41.81 
 
 		 494 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  41.2 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  41.2 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  41.2 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  40.04 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  40.4 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  40.76 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  40.98 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  43.68 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  38.85 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  40.21 
 
 		 494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  39.31 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  37.34 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  38.71 
 
 		 485 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  36.82 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  38.23 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  37.22 
 
 		 473 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  36.09 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  36.31 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  35.33 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  39.5 
 
 		 497 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  35.99 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  34.23 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  38.85 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  36.75 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.46 
 
 		 495 aa  240  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.81 
 
 		 479 aa  239  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  36.58 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  37.87 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  37.99 
 
 		 484 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  37.99 
 
 		 497 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  37.99 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  37.99 
 
 		 484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  37.99 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  37.99 
 
 		 484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  38.66 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  37.99 
 
 		 484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  36.44 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  38.18 
 
 		 468 aa  233  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  35.46 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  36.15 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  37.5 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  36.46 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.66 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  36.91 
 
 		 481 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.04 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.44 
 
 		 458 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  38.36 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  36.48 
 
 		 485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.14 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  37.09 
 
 		 463 aa  209  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  36.44 
 
 		 494 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.19 
 
 		 469 aa  203  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  35.27 
 
 		 459 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.9 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.8 
 
 		 470 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.99 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  34.03 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  33.33 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  33.83 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  34.67 
 
 		 495 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  35.65 
 
 		 469 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.17 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.33 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.09 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  36.07 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0671  Amidase  33.75 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.35 
 
 		 461 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.7 
 
 		 463 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.33 
 
 		 485 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  31.47 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  34.74 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.02 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.06 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.64 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.46 
 
 		 479 aa  188  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.27 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>