More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0497 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  100 
 
 		 481 aa  946    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  78.11 
 
 		 480 aa  670    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  55.74 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  55.16 
 
 		 494 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  54.95 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  53.68 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  52.83 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  54.33 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  52.35 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  56.68 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  52.6 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  53.03 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  52.6 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  52.6 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  53.08 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  55.16 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  52.87 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  52.23 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  52.23 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  53.73 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  52.48 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  53.14 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  51.9 
 
 		 497 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  50.32 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  50.21 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  51.6 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  50.1 
 
 		 484 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  49.79 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  49.9 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  49.79 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  49.9 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  51.05 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  49.9 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  50.1 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  50.94 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  45.17 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  48.54 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  46.35 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  48.59 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  46.85 
 
 		 463 aa  346  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  46.7 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  43.79 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  46.97 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  44.19 
 
 		 466 aa  323  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  43.19 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  43.07 
 
 		 472 aa  292  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  42.14 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  41.01 
 
 		 487 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  41.3 
 
 		 490 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  45.51 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.58 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  38.11 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  38.99 
 
 		 507 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  40.76 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  38.72 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  42.39 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  41.01 
 
 		 498 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  38.85 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  38.85 
 
 		 516 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  41.19 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  39.32 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  38.61 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  37.08 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  35.06 
 
 		 495 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  37.66 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.94 
 
 		 480 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  37.42 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  37.53 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  37.55 
 
 		 522 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  37.37 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  38.41 
 
 		 508 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  36.95 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.51 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  36.8 
 
 		 475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.63 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.98 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  38.56 
 
 		 535 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.47 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.74 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.36 
 
 		 505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  31.52 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.68 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.01 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.26 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.52 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.06 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.5 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.87 
 
 		 489 aa  190  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.44 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6034  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.28 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  29.93 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.1 
 
 		 498 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.64 
 
 		 486 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08740  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.09 
 
 		 503 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.21 
 
 		 467 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.98 
 
 		 516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  33.89 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  31.85 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1461  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.9 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  33.12 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>