More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0983 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0983  amidase  100 
 
 		 485 aa  964    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  60.38 
 
 		 494 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  60.08 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  61.38 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  60.17 
 
 		 485 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  60.38 
 
 		 485 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  62.21 
 
 		 485 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  60.29 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  57.51 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  57.51 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  57.51 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  57.08 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  56.45 
 
 		 494 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  56.9 
 
 		 494 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  56.66 
 
 		 494 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  56.87 
 
 		 497 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  56.87 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  57.08 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  56.87 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  56.87 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  54.41 
 
 		 491 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  57.05 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  56.87 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  56.66 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  54.41 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  56.88 
 
 		 556 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  58.44 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  56.49 
 
 		 505 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  56.65 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  58.75 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  54.45 
 
 		 495 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  55.74 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  51.79 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  54.32 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  55.22 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  45.83 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  47.54 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  49.22 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  46.61 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  48.45 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  47.94 
 
 		 463 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  47.64 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  46.67 
 
 		 463 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  42.48 
 
 		 490 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  42.37 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  42.83 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  40.6 
 
 		 487 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  41.67 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  41.26 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  41.75 
 
 		 472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  42.98 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  40.04 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  39 
 
 		 509 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  38.02 
 
 		 477 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  39.19 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  39.16 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  38.58 
 
 		 516 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  36.4 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  38.58 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  38.38 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  38.55 
 
 		 522 aa  223  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  37.55 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  37.95 
 
 		 507 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  36.96 
 
 		 507 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.08 
 
 		 495 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  35.86 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  33.82 
 
 		 495 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.4 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  36.92 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  36.53 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  35.82 
 
 		 506 aa  209  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  36.13 
 
 		 507 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.03 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.29 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 		 486 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  32.11 
 
 		 486 aa  203  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.54 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  35.13 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.46 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  36.17 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.97 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  35.46 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.4 
 
 		 494 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  34.73 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  36.21 
 
 		 469 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.51 
 
 		 485 aa  192  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.94 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  36.34 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.99 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  35.53 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  35.34 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  35.19 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.8 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  36.34 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.52 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  36.73 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  32.75 
 
 		 483 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.61 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  35.11 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>