More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2402 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2402  amidase  100 
 
 
492 aa  988    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  60.92 
 
 
498 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  57.66 
 
 
498 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  49.4 
 
 
495 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  49.04 
 
 
507 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  49.04 
 
 
507 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  52.85 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  49.05 
 
 
509 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  48.63 
 
 
507 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  50.95 
 
 
508 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  47.69 
 
 
516 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  47.27 
 
 
516 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  50.42 
 
 
507 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  46.64 
 
 
522 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  49.05 
 
 
506 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  41.39 
 
 
472 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  45.22 
 
 
466 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  42.79 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  39.6 
 
 
477 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  45.33 
 
 
463 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  43.35 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  40.17 
 
 
472 aa  312  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  43.23 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  40.39 
 
 
477 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  42.65 
 
 
477 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  40.17 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  43.57 
 
 
472 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.21 
 
 
479 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  41.31 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  40.64 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  40.89 
 
 
494 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  41.39 
 
 
494 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  41.39 
 
 
494 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  41.39 
 
 
494 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  41.3 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  40.65 
 
 
494 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  39.29 
 
 
473 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  38.02 
 
 
494 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  38.16 
 
 
496 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  37.76 
 
 
491 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  37.82 
 
 
494 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  38.68 
 
 
471 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  37.28 
 
 
485 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  36.21 
 
 
485 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  36.42 
 
 
556 aa  242  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  38.46 
 
 
521 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  38.51 
 
 
505 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  36.93 
 
 
490 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  36.18 
 
 
481 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.45 
 
 
480 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  36.24 
 
 
472 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  38.89 
 
 
458 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  38.61 
 
 
481 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  35.71 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  36.09 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  37 
 
 
487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  37.55 
 
 
497 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  36.06 
 
 
485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  38.68 
 
 
485 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.06 
 
 
473 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  37.39 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  37.39 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  37.39 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  36.05 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  36.17 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  37.39 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  37.39 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  37.47 
 
 
546 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.9 
 
 
461 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  34.42 
 
 
492 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  36.77 
 
 
480 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  38.9 
 
 
463 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  37.17 
 
 
484 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  38.16 
 
 
480 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.21 
 
 
495 aa  217  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  33.89 
 
 
499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  32.4 
 
 
475 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.67 
 
 
467 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.23 
 
 
471 aa  203  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  32.1 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  36.44 
 
 
459 aa  200  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  35.32 
 
 
469 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.1 
 
 
469 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  35.23 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  35.32 
 
 
469 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  36.59 
 
 
461 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.48 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  35.36 
 
 
469 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  32.73 
 
 
483 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  33.12 
 
 
468 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.45 
 
 
486 aa  193  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.86 
 
 
486 aa  193  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.9 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  33.33 
 
 
486 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  33.62 
 
 
471 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.84 
 
 
469 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  36.21 
 
 
471 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.6 
 
 
486 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.13 
 
 
470 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.63 
 
 
486 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>