More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2170 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  100 
 
 		 487 aa  993    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  74.11 
 
 		 490 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  73.43 
 
 		 490 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  50 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  50.87 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  49.15 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  48.5 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  49.02 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  47.94 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  45.41 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  43.15 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  45.63 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  42.95 
 
 		 494 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  43.19 
 
 		 494 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  43.19 
 
 		 494 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  43.19 
 
 		 494 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  42.35 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  41.67 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  45.42 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  39.45 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  42.46 
 
 		 497 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  39.53 
 
 		 496 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  42.03 
 
 		 497 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  42.03 
 
 		 484 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  42.03 
 
 		 484 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  42.03 
 
 		 484 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  42.03 
 
 		 484 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  42.03 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  42.03 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  40.6 
 
 		 485 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  44.81 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  38.21 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  42.07 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  38.59 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  41.6 
 
 		 521 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  42.79 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  40.38 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  40.35 
 
 		 473 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  40.59 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  41.25 
 
 		 485 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  40.17 
 
 		 482 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  40.98 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  41.01 
 
 		 481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  38.48 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  42.27 
 
 		 495 aa  283  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  39.79 
 
 		 477 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  39.92 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  38.8 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  40 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  40.33 
 
 		 494 aa  269  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  39.56 
 
 		 471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  38.38 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  37.91 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.96 
 
 		 473 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  41.98 
 
 		 480 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  36.77 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  37.07 
 
 		 507 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  38.7 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  37.58 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  34.63 
 
 		 495 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  37.39 
 
 		 492 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  35.92 
 
 		 498 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  36.97 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  36.75 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  34.96 
 
 		 522 aa  232  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  39.46 
 
 		 463 aa  232  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  37 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  35.01 
 
 		 472 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  35.68 
 
 		 475 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  37.18 
 
 		 507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  36.88 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  34.72 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  35.67 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  34.68 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  37.29 
 
 		 504 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  34.47 
 
 		 469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  36.34 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.65 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.78 
 
 		 458 aa  210  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.81 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  33.97 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.08 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  35.68 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.89 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.78 
 
 		 485 aa  203  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.23 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.94 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.89 
 
 		 488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.26 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.14 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.05 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  34.24 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  32.61 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.26 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.69 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.59 
 
 		 486 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.26 
 
 		 491 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 		 483 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  31.97 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.28 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>