More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4143 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2827  amidase  79.11 
 
 		 495 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  100 
 
 		 486 aa  979    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  75.52 
 
 		 494 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  57.81 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  58.53 
 
 		 494 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  58.44 
 
 		 485 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  56.75 
 
 		 485 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  56.53 
 
 		 485 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  55.46 
 
 		 485 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  51.86 
 
 		 491 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  51.65 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  56.1 
 
 		 485 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  53.53 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  53.53 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  52.9 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  53.53 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  52.7 
 
 		 494 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  52.49 
 
 		 494 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  52.07 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  54.85 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  54.32 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  53.32 
 
 		 497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  53.32 
 
 		 546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  54.28 
 
 		 485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  53.12 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  53.12 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  53.12 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  53.33 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  53.33 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  52.93 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  52.82 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  53.14 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  51.49 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  50.21 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  53.21 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  44.21 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0870  amidase  50.33 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  47.33 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  43.88 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  42.92 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  44.47 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  42.68 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  43.72 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  42.07 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  40.89 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  40.89 
 
 		 490 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  40 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  39.67 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.78 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  38.7 
 
 		 472 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  40.56 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  37.36 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  37.44 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  37.47 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  35.92 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  38.17 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  36.11 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  37 
 
 		 477 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  35.84 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  36.03 
 
 		 498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  34.83 
 
 		 507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  34.91 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  35.68 
 
 		 471 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  32.26 
 
 		 495 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  33.83 
 
 		 507 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.24 
 
 		 495 aa  206  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  35.33 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  34.76 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  36.32 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  34.74 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.12 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  34.04 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  35.05 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  32.24 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  34.84 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.63 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  31.94 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  33.9 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  33.69 
 
 		 469 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  33.98 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.91 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  33.84 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.03 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.41 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.4 
 
 		 463 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  32.04 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.48 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  33.04 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.27 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  34.78 
 
 		 504 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.18 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.1 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.16 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.19 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.47 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.56 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.21 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  32.92 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.02 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  43.75 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>