More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1465 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1465  amidase  100 
 
 		 535 aa  1073    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  62.8 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  63.1 
 
 		 507 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  65.16 
 
 		 509 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  65.74 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  65.42 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  62.65 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  62.65 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  61.85 
 
 		 522 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  63.76 
 
 		 506 aa  567  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  63.41 
 
 		 507 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  52.85 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  53.88 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  50.52 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  43.69 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  38.53 
 
 		 477 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  43.24 
 
 		 463 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  42.04 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  41.33 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  38.95 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  40.57 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  38.46 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  39.25 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  40.25 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  43.38 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  38.64 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  40 
 
 		 477 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  36.74 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.83 
 
 		 479 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  37.82 
 
 		 494 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  39.19 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  37.73 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  37.32 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  37.32 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  37.32 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  37.87 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  37.63 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  39.26 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  36.58 
 
 		 490 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  36.64 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.75 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  35.59 
 
 		 487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  35.7 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  35.82 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  36.31 
 
 		 496 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  35.11 
 
 		 475 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  35.7 
 
 		 494 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  38.98 
 
 		 481 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  36.81 
 
 		 469 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.03 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  36.4 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  37.84 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  36.38 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  35.43 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  35.18 
 
 		 485 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  36.82 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.49 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  34.62 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.46 
 
 		 495 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.01 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  35.03 
 
 		 499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  40.17 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  37.04 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  37.13 
 
 		 485 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  36.33 
 
 		 505 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.04 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  37.5 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  35.81 
 
 		 485 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.91 
 
 		 470 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.74 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  35.01 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.13 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  35.96 
 
 		 546 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.22 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  35.96 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  35.96 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  35.96 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.05 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  35.96 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  35.96 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  36 
 
 		 504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  34.79 
 
 		 495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  33.7 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  34.61 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  35.47 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  34.78 
 
 		 485 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  34.81 
 
 		 459 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.06 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  36.44 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.26 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  34.97 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.66 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  32.19 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.48 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.75 
 
 		 470 aa  193  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  31.13 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  32.89 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  34.12 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>