More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0671 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0671  Amidase  100 
 
 
503 aa  998    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.378102  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  42.34 
 
 
480 aa  333  5e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  40.82 
 
 
499 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  41.3 
 
 
495 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.1 
 
 
473 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  37.5 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.47 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.61 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  36.13 
 
 
475 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.94 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  36.89 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  34.53 
 
 
494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  34.53 
 
 
494 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.54 
 
 
472 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.86 
 
 
494 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  35.04 
 
 
492 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  34.29 
 
 
494 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  36.51 
 
 
466 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  35.21 
 
 
471 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.73 
 
 
470 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.83 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.53 
 
 
494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.53 
 
 
494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.53 
 
 
494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  34.69 
 
 
467 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.46 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.43 
 
 
469 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.91 
 
 
463 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  35.48 
 
 
468 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  34.37 
 
 
516 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  34.37 
 
 
516 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  34.95 
 
 
509 aa  193  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  32.66 
 
 
475 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.53 
 
 
471 aa  193  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  33.81 
 
 
549 aa  193  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  32.85 
 
 
507 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  32.13 
 
 
473 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  32.45 
 
 
482 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  32.18 
 
 
477 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  32.5 
 
 
494 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.75 
 
 
475 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.5 
 
 
485 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  31.55 
 
 
485 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  35.77 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.35 
 
 
483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.69 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  33.4 
 
 
498 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  33.33 
 
 
486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.83 
 
 
486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  31.36 
 
 
495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.37 
 
 
496 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  32.04 
 
 
507 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  32.72 
 
 
477 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.87 
 
 
474 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  34.72 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  35.66 
 
 
507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.05 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  30.04 
 
 
472 aa  179  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.63 
 
 
486 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  34.52 
 
 
469 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.8 
 
 
485 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  33.4 
 
 
522 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.03 
 
 
486 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.82 
 
 
473 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  34.13 
 
 
469 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  32.29 
 
 
477 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  34.02 
 
 
478 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1318  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.27 
 
 
502 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.47 
 
 
489 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  37.5 
 
 
469 aa  177  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  36.16 
 
 
471 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.49 
 
 
485 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.78 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.49 
 
 
485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.05 
 
 
484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  34.33 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.98 
 
 
485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  35.41 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.4 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.37 
 
 
494 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.52 
 
 
479 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  32.72 
 
 
507 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  30.77 
 
 
556 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
487 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  36.45 
 
 
504 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.34 
 
 
494 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.31 
 
 
491 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  32.11 
 
 
468 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.16 
 
 
486 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  37.21 
 
 
472 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.47 
 
 
476 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  32.43 
 
 
461 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  35.83 
 
 
476 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  34.9 
 
 
477 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.2 
 
 
505 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  34.1 
 
 
471 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  35.07 
 
 
469 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  34.83 
 
 
508 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.66 
 
 
479 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  32.43 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>