More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3206 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  100 
 
 		 468 aa  967    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  55.79 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  55.36 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  55.36 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  47.2 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  46.89 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  45.01 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  45.97 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  43.58 
 
 		 468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  46.51 
 
 		 504 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  44.67 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  41.87 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  43.46 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  43.01 
 
 		 469 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  42.98 
 
 		 469 aa  324  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  43.44 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  39.25 
 
 		 491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  41.22 
 
 		 483 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  38.38 
 
 		 474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  38.6 
 
 		 468 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  37 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  37.22 
 
 		 469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  39.36 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  39.29 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  38.05 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  39.12 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  39.09 
 
 		 471 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  38.33 
 
 		 469 aa  266  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  38.05 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  37.15 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.38 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  37.88 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.12 
 
 		 477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.43 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  35.91 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  32.82 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  32.61 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  33.33 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.26 
 
 		 475 aa  216  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  32.97 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.6 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  34.14 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.11 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  34.29 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  32.44 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  31.95 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.69 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  33.63 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  31.87 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  31.15 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  31.85 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  33.26 
 
 		 490 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  35.04 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  34.05 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  32.54 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.07 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  31.68 
 
 		 471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  32.37 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  32.37 
 
 		 467 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  32.83 
 
 		 490 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.41 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  29.96 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  32.75 
 
 		 464 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  31.91 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.94 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  32.91 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.59 
 
 		 485 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  32.9 
 
 		 477 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  31.66 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6180  amidase  30.98 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  32.31 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  32.31 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  31.85 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  32.31 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.75 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  31.48 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.26 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  31.36 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.05 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  28.72 
 
 		 496 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  31.88 
 
 		 464 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  31.88 
 
 		 464 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  30.04 
 
 		 490 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  31.25 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  30.53 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  28.99 
 
 		 475 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  30.41 
 
 		 494 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  32.98 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  30.11 
 
 		 491 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.9 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  31.86 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.02 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  30.11 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  30.99 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  28.91 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  30.62 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  30.22 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  30.62 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  30.62 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>