More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4545 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  100 
 
 		 468 aa  932    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  55.76 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  47.26 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  50.78 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  50.33 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  49.34 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  43.58 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  50.11 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  51.52 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  47.08 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  46.52 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  44.73 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  47.45 
 
 		 474 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  50.64 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  49.57 
 
 		 469 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  47.17 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  49.01 
 
 		 469 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  46.68 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  47.65 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  45.27 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  44.81 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  44.64 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  44.37 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  44.21 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  43.67 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  42.67 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  40.25 
 
 		 477 aa  266  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  41.48 
 
 		 491 aa  259  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  37.26 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  42.89 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  39.69 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  38.31 
 
 		 475 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  39.4 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  37.95 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  39.7 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  38.02 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  40.26 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  40.43 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  39.74 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  36.56 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  37.33 
 
 		 467 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  42.7 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  39.22 
 
 		 486 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  36.66 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  41.36 
 
 		 464 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  37.5 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  40.08 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  37.39 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.05 
 
 		 472 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  41.25 
 
 		 470 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  39.01 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  39.01 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  36.63 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  36.76 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  38.79 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  38.62 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  37.12 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  38.58 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  38.58 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  37.47 
 
 		 490 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.54 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  37.69 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.51 
 
 		 499 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  38.74 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  38.74 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  39.56 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1643  amidase  40.48 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0396025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  36.4 
 
 		 473 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.08 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  36.72 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  34.55 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.8 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  40.18 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.54 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.9 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  38.57 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  38.36 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  38.36 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  35.49 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.97 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  33.86 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  35.32 
 
 		 487 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.29 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  37.21 
 
 		 490 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  34.53 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  33.91 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  37.26 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.76 
 
 		 485 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  34.33 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  34.33 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.52 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  34.33 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.96 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  34.18 
 
 		 494 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.41 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.39 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.02 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  34.55 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  35.67 
 
 		 466 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  37.77 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>