More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3117 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  100 
 
 		 495 aa  967    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  68.54 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  43.66 
 
 		 470 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  44.58 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  44.35 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  44.42 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  43.29 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  40.16 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  44.22 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  44.06 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  39.68 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01110  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  43.75 
 
 		 502 aa  249  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  41.73 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  40.16 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  37.53 
 
 		 465 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  41.13 
 
 		 488 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  36.07 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  35.86 
 
 		 467 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  37.63 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.37 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.07 
 
 		 472 aa  200  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  35.47 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.53 
 
 		 477 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.06 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.05 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.05 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  35.05 
 
 		 489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  35.79 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.73 
 
 		 472 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  41.73 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  37.4 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  34.65 
 
 		 476 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.24 
 
 		 470 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  33.4 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.33 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.4 
 
 		 475 aa  177  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  32.25 
 
 		 503 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  32.18 
 
 		 470 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  35.09 
 
 		 490 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  38.22 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  31.62 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  36.14 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.47 
 
 		 479 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.73 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  37.17 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  29.73 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  34.36 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  33.47 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  33.4 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  33.47 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  34.07 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.82 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  32.99 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.1 
 
 		 494 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  36.53 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  35.78 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  36.29 
 
 		 476 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  33.27 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  33.79 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  32.46 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  33.08 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.97 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  31.62 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.74 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  33.95 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.81 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  35.13 
 
 		 491 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.6 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  34.9 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  35.25 
 
 		 484 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  33.71 
 
 		 493 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  32.99 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  31.82 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  30.75 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  33 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  30.97 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  34.57 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  30.97 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  30.97 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  36.86 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  32.37 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  36.15 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  35.47 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.35 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.08 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  34.66 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.94 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  30.81 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34 
 
 		 499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  33.13 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  33.13 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  33.13 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  32.33 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  30.26 
 
 		 494 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  35.07 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  35.23 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  35.23 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  35.23 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  31.9 
 
 		 480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  33.33 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>