More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  100 
 
 		 489 aa  950    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  55.35 
 
 		 480 aa  355  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  47.8 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  45.81 
 
 		 476 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  44.16 
 
 		 475 aa  289  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  43.91 
 
 		 476 aa  282  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  41.11 
 
 		 477 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  44.65 
 
 		 477 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  42.41 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  42.4 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.98 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  39.49 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  41.14 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  40.95 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  38.68 
 
 		 495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  40.95 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  40.95 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  37.95 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  40.21 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  40.51 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  35.59 
 
 		 467 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  35.19 
 
 		 467 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  37.84 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  37.34 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  34.85 
 
 		 488 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  37.17 
 
 		 475 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  34.95 
 
 		 465 aa  196  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  39.68 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  36.02 
 
 		 531 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.12 
 
 		 493 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  40.82 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  36.8 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  36.09 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  37.11 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  37.11 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  37.11 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  36.08 
 
 		 471 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40.05 
 
 		 483 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 473 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  37.98 
 
 		 472 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  34.35 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  32.08 
 
 		 503 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  36.36 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  33.2 
 
 		 519 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.32 
 
 		 498 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  37.38 
 
 		 492 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  36.9 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  33.4 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  36.67 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  35.14 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  38.42 
 
 		 501 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  36.47 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.38 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.24 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  34.48 
 
 		 502 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.91 
 
 		 508 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  33.52 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  31.61 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  32.13 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  35.4 
 
 		 495 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  36.22 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  33.33 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  36.92 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  34.01 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  35.55 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  36.19 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01110  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.34 
 
 		 502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  32.51 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  31.81 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.42 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  39.37 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  34.3 
 
 		 503 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  35.75 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  37.92 
 
 		 502 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.06 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  29.27 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  38.07 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  38.02 
 
 		 495 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  36.34 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.85 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  37.84 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  30.24 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  31.96 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  40.05 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  38.65 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  35.91 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  29.96 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  30.58 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.41 
 
 		 502 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  37.6 
 
 		 489 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  38.02 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  30.6 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  38.02 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.59 
 
 		 509 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  34.29 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  34.43 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  33.75 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.18 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  33.68 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  33.14 
 
 		 506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>