More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4525 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4525  amidase  100 
 
 		 467 aa  941    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  78.92 
 
 		 465 aa  733    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  65.65 
 
 		 467 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  65.86 
 
 		 467 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  43.79 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  43.84 
 
 		 476 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  44.7 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  43.6 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  42.76 
 
 		 477 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  43.13 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  40.68 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  41.82 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  43.59 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  39.92 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  35.26 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  40.79 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  36.52 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  37.71 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  41.09 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  36.14 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  36.14 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.4 
 
 		 482 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  36.14 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.22 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  35.63 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  36.42 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.11 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  38.14 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.45 
 
 		 493 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.55 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.19 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  34.18 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.93 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  37.47 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  38.34 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  34.97 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  41.18 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  37 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  34.48 
 
 		 503 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  35.61 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  37.11 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  36.85 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.33 
 
 		 501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.21 
 
 		 508 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.37 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  39.1 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  34.86 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  33.62 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  34.22 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  34.77 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  34.06 
 
 		 506 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  32.48 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  36.02 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  36.02 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  36.02 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  34.99 
 
 		 491 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  37.63 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  36.23 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  34.41 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  34.64 
 
 		 519 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  34.33 
 
 		 522 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  36.7 
 
 		 495 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  38.27 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  34.7 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  34.31 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.74 
 
 		 473 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  32.08 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  35.7 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.2 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  34.34 
 
 		 493 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  34.16 
 
 		 476 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.9 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.49 
 
 		 486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.71 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.26 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.66 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.66 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.66 
 
 		 496 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.46 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.66 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  36.5 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  34.46 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.69 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  36.51 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  33.19 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  34.46 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.16 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  32.98 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  35.49 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  41.4 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  34.84 
 
 		 504 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  37.42 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.64 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  38.74 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  34.72 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  35.64 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  40.32 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.9 
 
 		 467 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.44 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>