More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2581 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2581  Amidase  100 
 
 
483 aa  924    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  43.28 
 
 
472 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  39.45 
 
 
483 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  38.91 
 
 
481 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  38.32 
 
 
492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  42.77 
 
 
476 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  37.96 
 
 
491 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.34 
 
 
492 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  40.36 
 
 
493 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  39.67 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  38.79 
 
 
493 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.4 
 
 
493 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  38.65 
 
 
495 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  39.88 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  39.35 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.96 
 
 
473 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.06 
 
 
476 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  40.37 
 
 
495 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.86 
 
 
503 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  38.76 
 
 
500 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  35.22 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  40.24 
 
 
502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  33.69 
 
 
488 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.1 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  37.95 
 
 
475 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  39.62 
 
 
474 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  36.49 
 
 
499 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  37.82 
 
 
491 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  37.82 
 
 
484 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.47 
 
 
502 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.58 
 
 
479 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  35.14 
 
 
476 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.03 
 
 
480 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  31.85 
 
 
490 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  37.82 
 
 
480 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  37.82 
 
 
480 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  36.65 
 
 
483 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  35.76 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  35.09 
 
 
519 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  37.18 
 
 
501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  35.61 
 
 
508 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  36.85 
 
 
476 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.32 
 
 
485 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  36.49 
 
 
495 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  36.84 
 
 
503 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.74 
 
 
494 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.41 
 
 
496 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  36.31 
 
 
474 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.74 
 
 
494 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.74 
 
 
494 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  38.03 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  33.26 
 
 
497 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  36.63 
 
 
481 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  33.06 
 
 
496 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  37.07 
 
 
474 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  37.63 
 
 
476 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  38.13 
 
 
517 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.33 
 
 
470 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  38.87 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.29 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  36.85 
 
 
489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  36.85 
 
 
489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.88 
 
 
496 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  37.93 
 
 
521 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  36.45 
 
 
489 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.68 
 
 
498 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  35.76 
 
 
490 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  37.56 
 
 
476 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  34.74 
 
 
481 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  36.63 
 
 
479 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  31.75 
 
 
531 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6180  Amidase  36.5 
 
 
470 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579752  normal  0.528616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  35.9 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  33.54 
 
 
483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  35.56 
 
 
492 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.24 
 
 
477 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  36.14 
 
 
465 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  35.67 
 
 
509 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  34.18 
 
 
472 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  34.75 
 
 
489 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  36.29 
 
 
476 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6359  Amidase  35.71 
 
 
470 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.62 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  35.01 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  34.19 
 
 
522 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  35.13 
 
 
477 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5337  amidase  37.07 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969017  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  37.45 
 
 
476 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  37.08 
 
 
488 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  38.76 
 
 
496 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.61 
 
 
473 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.96 
 
 
492 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  33.4 
 
 
506 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  35.55 
 
 
475 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  35.08 
 
 
492 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  34.3 
 
 
502 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  32.8 
 
 
504 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  32.22 
 
 
475 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  30.35 
 
 
472 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  37.53 
 
 
489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>