More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0151 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  100 
 
 
475 aa  945    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  88 
 
 
471 aa  779    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  59.91 
 
 
471 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  49.79 
 
 
471 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  44.44 
 
 
474 aa  323  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  45.36 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  42.83 
 
 
467 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  42.37 
 
 
469 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  42.58 
 
 
469 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  44.91 
 
 
477 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  42.16 
 
 
469 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  44.81 
 
 
468 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  39.36 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  41.31 
 
 
469 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  40.86 
 
 
471 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  41.7 
 
 
470 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  40.99 
 
 
471 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  43.44 
 
 
504 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  39.33 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  43.48 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  40.69 
 
 
469 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  39.87 
 
 
469 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  39.45 
 
 
492 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  38.84 
 
 
491 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  35.96 
 
 
477 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  39.52 
 
 
471 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  37.47 
 
 
468 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  42.3 
 
 
469 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.97 
 
 
472 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.91 
 
 
473 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  39.4 
 
 
469 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  36.84 
 
 
475 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.4 
 
 
483 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  37.28 
 
 
478 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  33.89 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  35.86 
 
 
464 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  35.86 
 
 
464 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.74 
 
 
495 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  35.86 
 
 
464 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.58 
 
 
486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.19 
 
 
472 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  37.53 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.2 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.88 
 
 
463 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.34 
 
 
458 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  35.44 
 
 
464 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  35.44 
 
 
464 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.79 
 
 
486 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  34.85 
 
 
466 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  36.46 
 
 
493 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.43 
 
 
499 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.12 
 
 
480 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.43 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.64 
 
 
459 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  33.76 
 
 
471 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  36.8 
 
 
470 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  32.55 
 
 
499 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  34.61 
 
 
494 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.26 
 
 
494 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.61 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  34.6 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.19 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  33.76 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.19 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.19 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.51 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.89 
 
 
485 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.15 
 
 
485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.37 
 
 
470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  33.47 
 
 
511 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.73 
 
 
461 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.56 
 
 
470 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.79 
 
 
494 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.48 
 
 
475 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.05 
 
 
476 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  32.68 
 
 
461 aa  180  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.03 
 
 
487 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.95 
 
 
489 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.53 
 
 
475 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
486 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  31.8 
 
 
494 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 
475 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4953  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0367  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.01 
 
 
479 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.9 
 
 
463 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  35.23 
 
 
464 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0768  amidase  35.23 
 
 
464 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0394  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0350  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0306  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0289  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  33.33 
 
 
490 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.92 
 
 
491 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  31.89 
 
 
495 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0353  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0321  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 
485 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0298  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.61 
 
 
485 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  33.83 
 
 
466 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>