More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1474 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  100 
 
 
680 aa  1402    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0866  cell wall anchor domain-containing protein  41.61 
 
 
637 aa  327  7e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.373011  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0612  Amidase  36.51 
 
 
529 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  38.48 
 
 
488 aa  288  2.9999999999999996e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  35.82 
 
 
486 aa  250  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.23 
 
 
508 aa  233  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  34.41 
 
 
499 aa  209  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.86 
 
 
501 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  31.62 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.07 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  30.6 
 
 
495 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  29.45 
 
 
499 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  31.98 
 
 
509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  31.63 
 
 
493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  32.91 
 
 
496 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  29.82 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  30.27 
 
 
476 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  30.87 
 
 
460 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  30.87 
 
 
460 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  32.06 
 
 
474 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  29.72 
 
 
489 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  30.92 
 
 
531 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.93 
 
 
473 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  29.98 
 
 
498 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  30.93 
 
 
519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  31.28 
 
 
474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  29.39 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  31.75 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  31.58 
 
 
476 aa  160  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  30.14 
 
 
502 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  28.95 
 
 
489 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  28.95 
 
 
489 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  28.95 
 
 
489 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  27.61 
 
 
481 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  29.92 
 
 
499 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  29.1 
 
 
482 aa  154  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  28.66 
 
 
479 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  30.24 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  30.88 
 
 
470 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  30.04 
 
 
472 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  29.33 
 
 
468 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  28.48 
 
 
490 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  27.55 
 
 
491 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  28.57 
 
 
480 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  28.57 
 
 
480 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  25.98 
 
 
502 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  29.33 
 
 
476 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  28.57 
 
 
480 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  29.75 
 
 
467 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  26.01 
 
 
492 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  28.78 
 
 
483 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  29.49 
 
 
492 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  29.01 
 
 
467 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  29.24 
 
 
479 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  25.85 
 
 
499 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  25.46 
 
 
472 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.08 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  28.93 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.94 
 
 
477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  27.11 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  29.57 
 
 
494 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  26.77 
 
 
475 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  29.96 
 
 
492 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  28.74 
 
 
499 aa  140  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  29.81 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  28.29 
 
 
524 aa  140  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  29.51 
 
 
474 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  30.18 
 
 
474 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  29.75 
 
 
492 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.01 
 
 
475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.27 
 
 
485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  28.22 
 
 
491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  29.4 
 
 
476 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  30.38 
 
 
476 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  28.69 
 
 
481 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  28.69 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  25.66 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  26.67 
 
 
496 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  27.77 
 
 
484 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0638  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.43 
 
 
494 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.42 
 
 
475 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  26.22 
 
 
475 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0232  Amidase  30.37 
 
 
472 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  27.63 
 
 
521 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  26.95 
 
 
470 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  26.95 
 
 
470 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  27.45 
 
 
470 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.15 
 
 
483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.63 
 
 
484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.84 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.84 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.84 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.84 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  27.78 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  29.77 
 
 
504 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.63 
 
 
496 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  27.63 
 
 
517 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  27.4 
 
 
472 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  26.64 
 
 
464 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  27.31 
 
 
469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>