More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0866 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0866  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 637 aa  1293    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.373011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  37.96 
 
 		 680 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  39.14 
 
 		 488 aa  283  7.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0612  Amidase  34.98 
 
 		 529 aa  273  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  35.11 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  35.15 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  33.47 
 
 		 508 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  33.2 
 
 		 501 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  31.77 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  30.75 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  31.43 
 
 		 509 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  32.43 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.77 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  29.84 
 
 		 489 aa  165  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  29.84 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  29.84 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  29.72 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  30.57 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  29.29 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  28.26 
 
 		 491 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  29.84 
 
 		 489 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  30.68 
 
 		 483 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.57 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  32.95 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  32.64 
 
 		 496 aa  154  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  28.4 
 
 		 476 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  30.37 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  34.13 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  31.75 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  28.12 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  31.98 
 
 		 476 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  28.98 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  30.9 
 
 		 475 aa  143  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  30.82 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  29.13 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  28.43 
 
 		 531 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  25.25 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  28.05 
 
 		 519 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  28.81 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  29.9 
 
 		 480 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  29.9 
 
 		 480 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  29.9 
 
 		 480 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  28 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  29.53 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  29.53 
 
 		 500 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  31.57 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  28.25 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  31.06 
 
 		 482 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  29.9 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  28.07 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  28.83 
 
 		 496 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  29.93 
 
 		 469 aa  130  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  29.7 
 
 		 491 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  28.88 
 
 		 479 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  29.64 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  30.45 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  27.87 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  27.8 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.8 
 
 		 494 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.8 
 
 		 496 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.8 
 
 		 494 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  28.97 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.8 
 
 		 494 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  25.99 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  27.8 
 
 		 517 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  27.8 
 
 		 496 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  24.8 
 
 		 477 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.09 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  31.03 
 
 		 462 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  28.11 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  26.87 
 
 		 502 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  27.69 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  27.96 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  27.11 
 
 		 487 aa  124  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  30.13 
 
 		 470 aa  123  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  29.12 
 
 		 476 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  27.31 
 
 		 473 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  26.25 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  28.97 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  29.85 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  27.33 
 
 		 489 aa  121  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  27.74 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0232  Amidase  31.14 
 
 		 472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  27.6 
 
 		 494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  27.2 
 
 		 483 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  28.66 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  26.05 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  27.7 
 
 		 490 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  29.05 
 
 		 464 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.65 
 
 		 483 aa  120  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  29.87 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  27.6 
 
 		 494 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  24.59 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  27.38 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  27.81 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  28.92 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  29.76 
 
 		 501 aa  117  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  25.05 
 
 		 494 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  25.05 
 
 		 494 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  25.05 
 
 		 494 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>