More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0612 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0612  Amidase  100 
 
 		 529 aa  1075    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  36.51 
 
 		 680 aa  297  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  36.31 
 
 		 488 aa  266  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0866  cell wall anchor domain-containing protein  34.98 
 
 		 637 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.373011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  32.37 
 
 		 486 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  30.14 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  31.56 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  28.72 
 
 		 501 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  28.29 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.57 
 
 		 473 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  27.53 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  27.2 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  27.9 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.85 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  27.96 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  27.81 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  25.79 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  27.78 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  27.66 
 
 		 489 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  28.63 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  26.01 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  27.78 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  27.78 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  29.18 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  26.73 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  26.51 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  26.37 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.75 
 
 		 498 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  28.12 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  27.37 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  28.34 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  25 
 
 		 491 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  27.01 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  26.98 
 
 		 475 aa  136  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  28.37 
 
 		 474 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  26.72 
 
 		 476 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  26.26 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  27.81 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  23.93 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  27.94 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  26.97 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  26.97 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  26.97 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  26.67 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.7 
 
 		 496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  27.29 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  24.6 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  24.43 
 
 		 477 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  24.39 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  26.19 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  29.02 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  26.61 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  24.19 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  25.83 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  24.7 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  24.25 
 
 		 469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  24.58 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 496 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  23.94 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 494 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 494 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 494 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  27.49 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  25.57 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  26.89 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  25.2 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  25.5 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  25.58 
 
 		 521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  28.01 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  28.01 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  25 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  26.19 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  24.54 
 
 		 506 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  23.05 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  24.29 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  28.4 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.18 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  25.36 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  26.76 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  27.23 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  25.15 
 
 		 476 aa  114  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  25 
 
 		 488 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  24.95 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  23.77 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  26.43 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  24.69 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  26.06 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  25.55 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  22.94 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  26.18 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  24.18 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  25.41 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  24.51 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  25.48 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  28.31 
 
 		 495 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  25 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  23.58 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  26.83 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  23.61 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>