96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2083 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2083  response regulator receiver protein  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0128449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0792  response regulator receiver protein  33.79 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08901  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.12 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.27 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.95 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  26.57 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.94 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  23.67 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  23.67 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.62 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.92 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  24.17 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.72 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  20.4 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.96 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.07 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  25.34 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  25.34 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  25.34 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.8 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.08 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4278  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.43 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0894003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  21.08 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01470  DNA-binding response regulator  25.73 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  24.66 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0745  two component LuxR family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  26.07 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  25.36 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  24.88 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.22 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  22.82 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  22.22 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.26 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.82 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 		 622 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  22.92 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  24.3 
 
 		 622 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1932  DNA-binding response regulator  29.06 
 
 		 219 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00601791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.62 
 
 		 234 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 215 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  18.44 
 
 		 215 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  23.68 
 
 		 214 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.45 
 
 		 220 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  24.46 
 
 		 201 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  22.33 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>