More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0745 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0745  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2917  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.58 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2916  response regulator receiver protein  58.87 
 
 		 142 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2970  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  37 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  34.62 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  35.1 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  35.1 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  35.1 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  35.1 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  33.97 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1539  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  34.16 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  33.65 
 
 		 455 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  30.19 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  31.19 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  30.2 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  31.03 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  34.15 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  35.1 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  27.67 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  31.73 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3481  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.016753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  27.67 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1526  two-component response regulator EsrB  30.73 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  hitchhiker  0.00169027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1489  EsrB  30.73 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121116  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1950  hypothetical protein  30.73 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  32.84 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>