More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0792 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0792  response regulator receiver protein  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08901  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  39.17 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2083  response regulator receiver protein  33.79 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0128449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  25.98 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  25.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  26.96 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  25.85 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  25.85 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  24.51 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.12 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.53 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  25.45 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  21.78 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  25.23 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  22.28 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.75 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  25.11 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  26.36 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  24.75 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  22.17 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.66 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.38 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  25.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  25.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  25.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.55 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  22.22 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  21.78 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  21.78 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  21.78 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  21.78 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  21.78 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.77 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.62 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.86 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  22.12 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  23.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.7 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.22 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  23.64 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.38 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.39 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1733  two component LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  24.77 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.66 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.87 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.24 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.33 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  25.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  24.12 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  21.15 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  24 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.21 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>