More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0662 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  100 
 
 		 397 aa  803    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  53.45 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5680  porin  64.77 
 
 		 192 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.024221  normal  0.409431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5681  porin  63.23 
 
 		 179 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336613  normal  0.546745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  30.73 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  30.3 
 
 		 375 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  29.8 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  29 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  31.14 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  32 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  31.77 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  30.7 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  30.22 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  30.22 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  30.22 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  30.79 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  30.9 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  31.65 
 
 		 373 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  31.03 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  31.53 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  31.53 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  31.53 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  31.53 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  31.03 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  31.01 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  31.03 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  30.75 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  30.39 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  27.72 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.49 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  30.3 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  30.53 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.34 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.22 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.79 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.68 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4994  porin  30.56 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  29.71 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.71 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  30.02 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  28.41 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.36 
 
 		 355 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  31.48 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  28.8 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  28.8 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  29.52 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  30.49 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  29.52 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  28.6 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.03 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  30.88 
 
 		 355 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  27.46 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.3 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  28.3 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  27.69 
 
 		 367 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  30.39 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.82 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  29.37 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  26.96 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  28.54 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  28.54 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  29.26 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  29.25 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  28.33 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  28.87 
 
 		 375 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  27.55 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  29.3 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  29.26 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  29.81 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  28.73 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  29.26 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.3 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  28.64 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  27.66 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  28.4 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  29.29 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  28.4 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  26.34 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  27.05 
 
 		 383 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  27.48 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  28.74 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.09 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  27.92 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  27.11 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  28.23 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  28.31 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  28.25 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  28.25 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  29.52 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  25.73 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  27.93 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  27.93 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  28.34 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  27.93 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  28.44 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  27.48 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  27.48 
 
 		 407 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  28.31 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  27.48 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  27.48 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>