More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4019 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  95.44 
 
 		 373 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 373 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  77.6 
 
 		 375 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  42.71 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33.93 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.9 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.64 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  32.98 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.04 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  33.93 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  28.12 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.69 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  34.2 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  30.25 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  30.25 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  30.25 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  33.06 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  31.58 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  31.64 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  31.64 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  30.79 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  31.77 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  31.19 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  32.02 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  29.17 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  29.05 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  30.77 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  32.65 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  29.17 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  30.83 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  30.26 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  33.58 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  32.89 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  29.21 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  33.58 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  33.58 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  28.82 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  30.16 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  28.54 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  28.54 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  28.54 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  28.54 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  28.28 
 
 		 377 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  28.28 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  28.28 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  31.76 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.57 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.66 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  33.86 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  32.66 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.05 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  34.08 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  29.95 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  31.34 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  30.42 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  31.93 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  31.08 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  28.76 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  31.09 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  31.09 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.81 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  30.16 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  31.27 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  31.25 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  31.25 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.09 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  32.82 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  30.79 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  30.21 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  32.16 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  31.27 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.77 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  30.18 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  31.27 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  30.21 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  31.27 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  30.85 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  31.33 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  29.27 
 
 		 357 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  29.4 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  29.38 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0029  outer membrane protein (porin)-like protein  30.83 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  29.46 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.16 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.6 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.16 
 
 		 385 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  30.42 
 
 		 471 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0041  outer membrane protein (porin)-like  30.83 
 
 		 435 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.13 
 
 		 352 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.6 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  30.14 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  31.47 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  30.77 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>