More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3010 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 398 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  43.92 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  42.86 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  41.96 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  34 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  33.33 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  31.61 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  32.01 
 
 		 397 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5681  porin  40.72 
 
 		 179 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336613  normal  0.546745 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.1 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  32.37 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  31.19 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  31.19 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  31.19 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  30.96 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  30.96 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.25 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  30.94 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  32.04 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  30.96 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  31.09 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.4 
 
 		 371 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  32.41 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  32.41 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  32.07 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  32.74 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  31.85 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.83 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  31.91 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  29.17 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.9 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  32.24 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  31.54 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.2 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  30.1 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  30.1 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  30.1 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  30.1 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  30.1 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  30.58 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  29.95 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  29.21 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  32.28 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0350  OmpC family outer membrane porin  29.86 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000145681  hitchhiker  0.00000929748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.63 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.22 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  30.95 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  28.8 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.64 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  30.64 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  29.53 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  31.95 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  31.99 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  30.73 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  29.14 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  31.75 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  29.14 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  28.78 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.23 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  29.33 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.29 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  29.06 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  29.49 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  30.7 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  30.2 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.13 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  30.94 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  29.55 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  29.68 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.28 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.61 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  29.68 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  31.39 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5937  porin  31.01 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  30.14 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  30.34 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  31.39 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  30.3 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  29.38 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  29.91 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  29.91 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.14 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  31.14 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  29.93 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  27.91 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  29.85 
 
 		 403 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  29.85 
 
 		 403 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  28.91 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  30.34 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  30.12 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.94 
 
 		 386 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  29.91 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  30.14 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  31.81 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  30.25 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.7 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>