More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0680 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  100 
 
 		 373 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  95.44 
 
 		 373 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  76 
 
 		 375 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  41.69 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  34.02 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.25 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.24 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  33.33 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  33.5 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  33.49 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  29.82 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  30.4 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  30.4 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  30.4 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  32.2 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  33.68 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  28.18 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  32.04 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  29.48 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.85 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  29.43 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  33.09 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  33.09 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  29.43 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  31.32 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  33.51 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  31.33 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  33.09 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  32.55 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  32.13 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  28.5 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  30.97 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  32.01 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  29.74 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  29.89 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  31.11 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  31.11 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  33.51 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  32.18 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.68 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  32.18 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.34 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  30.87 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  30.87 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  31.93 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  32.07 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  31.93 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  31.93 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  31.93 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  28.29 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  28.05 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  28.05 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  31.09 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  28.29 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  28.29 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  28.29 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  27.32 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  33.07 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  30.57 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  32.7 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  32.7 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  32.7 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  33.07 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  30.69 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  34.12 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  31.27 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  29.85 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  31.51 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  30.75 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  32.11 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  30.16 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.47 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  31.32 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.3 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  30.48 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  30.53 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  30.53 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  30.6 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  30 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  30.98 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  32.5 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  32.76 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  30.6 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  32.35 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  29.89 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  28.84 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  30.05 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  30.33 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  30.69 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  29.58 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  31.75 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>