More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3860 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  100 
 
 		 384 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4994  porin  63.74 
 
 		 381 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  62.6 
 
 		 381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  60.99 
 
 		 382 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  47.65 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  48.93 
 
 		 387 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  46.6 
 
 		 388 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  47.12 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  45.61 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  45.61 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  45.48 
 
 		 387 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  43.95 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3144  porin  49.39 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  46.8 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  44.39 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  43.22 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  41.39 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  43.08 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  43.35 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  44.2 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  39.61 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  37.98 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  38.3 
 
 		 355 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  37.11 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  38.4 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  37.63 
 
 		 355 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  37.63 
 
 		 355 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  36.88 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  35.62 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  36.88 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  37.05 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  38.44 
 
 		 353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  36.92 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  39.69 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  37.73 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.59 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  34.59 
 
 		 362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  33.77 
 
 		 357 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  37.16 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  36.79 
 
 		 379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  36.29 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  35.88 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.88 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  37.14 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  36.7 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  35.4 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  33.5 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  33.5 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  35.26 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  33.01 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  33.17 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  34.33 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  32.01 
 
 		 383 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  34.5 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  34.07 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.92 
 
 		 367 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  34.68 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.97 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.97 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  35 
 
 		 364 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  36.03 
 
 		 363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2917  outer membrane porin  32.13 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1274  porin  32.13 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.688217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1952  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.832177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  35.2 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1256  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0969  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.449227  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2230  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.856101  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  33.66 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.04 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3041  outer membrane porin  31.75 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.46 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  31.9 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  31.65 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2236  porin  33.16 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  31.65 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.22 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  33.07 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  30.86 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  32.85 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  32.41 
 
 		 394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  32.85 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  31.66 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  34.48 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  34 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  36.78 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.17 
 
 		 449 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  34.9 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  32.95 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  33.17 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.27 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  35.5 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  30.66 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.27 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  31.31 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.27 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.27 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  30.66 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>