69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5763 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5763  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.375641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5996  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.64 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  31.71 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.68 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  29.61 
 
 		 563 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.21 
 
 		 579 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37 
 
 		 576 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  33.59 
 
 		 542 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  35 
 
 		 571 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 415 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  28.87 
 
 		 557 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  34.86 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 327 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  26.36 
 
 		 142 aa  48.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  27.33 
 
 		 560 aa  48.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32 
 
 		 840 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 637 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 631 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 593 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.18 
 
 		 470 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  26.36 
 
 		 544 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  32.95 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  27 
 
 		 733 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  31.46 
 
 		 265 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  31.11 
 
 		 503 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.29 
 
 		 797 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  31.46 
 
 		 265 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  31.63 
 
 		 423 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  27.45 
 
 		 179 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  33.33 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  38.96 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.33 
 
 		 581 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.79 
 
 		 554 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  35.37 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 444 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  35.44 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.87 
 
 		 464 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  30.28 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  31.96 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.02 
 
 		 532 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  31.18 
 
 		 417 aa  42.7  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 		 555 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  47.73 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  30.48 
 
 		 546 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 849 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 698 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.93 
 
 		 314 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 406 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 503 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 406 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  30.85 
 
 		 1556 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  31.07 
 
 		 283 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  40.35 
 
 		 389 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.51 
 
 		 457 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  34.04 
 
 		 420 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.7 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  29.7 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.14 
 
 		 457 aa  41.6  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.33 
 
 		 1001 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  25.17 
 
 		 583 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  29.79 
 
 		 419 aa  41.6  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>