More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0250 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
554 aa  1116    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.07 
 
 
686 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
573 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  48.77 
 
 
574 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
625 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  48.77 
 
 
574 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 
560 aa  297  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 
687 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  49.18 
 
 
650 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42 
 
 
668 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
425 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000628943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
558 aa  240  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
749 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 
739 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 
681 aa  223  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.766428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
545 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0205  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
647 aa  207  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2482  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.04 
 
 
673 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  40.95 
 
 
347 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
518 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 
741 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
573 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
566 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 
572 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
538 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  35.89 
 
 
565 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 
562 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
535 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 
528 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 
567 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 
730 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  38.75 
 
 
533 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
731 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
432 aa  190  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.190903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 
545 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
522 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 
688 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
688 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
730 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 
587 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  40.53 
 
 
559 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.71 
 
 
676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 
698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  38.72 
 
 
538 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 
540 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
563 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  35.33 
 
 
531 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 
1150 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
655 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  50.44 
 
 
965 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
535 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
561 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
563 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
674 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
536 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 
558 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 
656 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
545 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
656 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  36.96 
 
 
562 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 
670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 
567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  40.12 
 
 
698 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 
904 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0205  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 
669 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
567 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 
674 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
558 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  35.42 
 
 
530 aa  180  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  38.19 
 
 
568 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 
675 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
561 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.04 
 
 
561 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 
563 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 
602 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
712 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 
561 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  36.94 
 
 
540 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
712 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 
560 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 
702 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  36.52 
 
 
691 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
561 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.47 
 
 
542 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 
858 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 
542 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
672 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  38.54 
 
 
543 aa  178  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
694 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
698 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
531 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 
688 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  38.28 
 
 
675 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
538 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 
563 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 
655 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>