More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2095 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
538 aa  1031    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  48.02 
 
 
533 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
537 aa  349  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
538 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  45.79 
 
 
533 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
545 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  57.95 
 
 
518 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.72 
 
 
538 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 
531 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  44.28 
 
 
530 aa  329  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  43.18 
 
 
540 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  49.65 
 
 
540 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.86 
 
 
545 aa  316  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  47.08 
 
 
543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  43.9 
 
 
538 aa  306  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 
528 aa  302  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
535 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.59 
 
 
522 aa  293  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  42.83 
 
 
562 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.91 
 
 
544 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  44.42 
 
 
542 aa  290  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.52 
 
 
523 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.96 
 
 
547 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
542 aa  283  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.77 
 
 
532 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.37 
 
 
544 aa  277  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.6 
 
 
546 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  42.41 
 
 
540 aa  276  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  41.44 
 
 
583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
623 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  51.37 
 
 
347 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
545 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.85 
 
 
538 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.8 
 
 
535 aa  266  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 
531 aa  264  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
394 aa  264  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
535 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  47.18 
 
 
407 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.45 
 
 
545 aa  261  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.74 
 
 
526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.36 
 
 
904 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  49.3 
 
 
540 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 
529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 
524 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
1150 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 
530 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
536 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
702 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
858 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.42 
 
 
397 aa  223  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 
715 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
573 aa  211  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
515 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 
554 aa  206  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.4 
 
 
493 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 
657 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
535 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
602 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 
686 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.11 
 
 
574 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.54 
 
 
574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
565 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 
566 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 
538 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.42 
 
 
650 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 
741 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 
572 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
731 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 
730 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
730 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 
560 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
566 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.08 
 
 
533 aa  191  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
656 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  39.53 
 
 
733 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
567 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 
688 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 
566 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 
562 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
562 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 
563 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
714 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  32.69 
 
 
565 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 
625 aa  187  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 
540 aa  187  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 
540 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 
656 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  34.53 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
965 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.53 
 
 
564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.17 
 
 
568 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 
687 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
691 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 
561 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>