More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4449 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
538 aa  1033    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  48.85 
 
 
538 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  56.44 
 
 
540 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  42.96 
 
 
545 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  51.18 
 
 
543 aa  347  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  48.96 
 
 
518 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  46.01 
 
 
533 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  42.94 
 
 
562 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.38 
 
 
545 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.93 
 
 
538 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
537 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  51.71 
 
 
533 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.45 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  44.1 
 
 
540 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.18 
 
 
528 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.69 
 
 
523 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  44.22 
 
 
530 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  43.82 
 
 
531 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  57.83 
 
 
540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.73 
 
 
547 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.71 
 
 
546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 
522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 
347 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.35 
 
 
542 aa  276  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
545 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
550 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  51.34 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 
532 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 
544 aa  273  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
542 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
529 aa  272  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.19 
 
 
394 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
535 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 
531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  42.88 
 
 
583 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 
545 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  53.48 
 
 
535 aa  267  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 
904 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 
526 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.33 
 
 
1150 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
535 aa  252  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.63 
 
 
544 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.44 
 
 
538 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.65 
 
 
536 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  39.48 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
539 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.26 
 
 
530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
858 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
524 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.44 
 
 
535 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
715 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
397 aa  220  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 
573 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  52.57 
 
 
965 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
686 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
657 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.24 
 
 
650 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
625 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 
562 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
702 aa  203  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
565 aa  203  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 
540 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 
564 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  32.92 
 
 
543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 
540 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
731 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 
561 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.5 
 
 
574 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.16 
 
 
716 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 
563 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 
557 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 
563 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
730 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
669 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
730 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 
493 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  29.17 
 
 
561 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 
741 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.25 
 
 
538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
688 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 
562 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 
563 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
656 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 
562 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
644 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.81 
 
 
574 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  35.9 
 
 
676 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
674 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 
563 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
656 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
566 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
563 aa  187  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 
563 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.52 
 
 
561 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
554 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>