More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
533 aa  1031    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  52.68 
 
 
533 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.29 
 
 
538 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.57 
 
 
537 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  55.74 
 
 
540 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  56.14 
 
 
543 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  48.15 
 
 
530 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 
531 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  48.71 
 
 
538 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  59.3 
 
 
518 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.4 
 
 
538 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
538 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  47.5 
 
 
540 aa  336  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  44.36 
 
 
562 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
528 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
545 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 
545 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 
535 aa  302  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  44.72 
 
 
540 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.25 
 
 
542 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.77 
 
 
546 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 
542 aa  296  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 
532 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
544 aa  292  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
522 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.54 
 
 
623 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 
394 aa  286  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 
535 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.33 
 
 
547 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 
407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.78 
 
 
545 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 
544 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
523 aa  269  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  41.64 
 
 
583 aa  266  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 
540 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.46 
 
 
347 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.44 
 
 
904 aa  260  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.6 
 
 
536 aa  257  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  50.47 
 
 
535 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 
538 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.52 
 
 
531 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
550 aa  243  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 
1150 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.04 
 
 
858 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
545 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 
539 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 
526 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
524 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
715 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 
562 aa  217  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 
530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
573 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
672 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 
656 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 
686 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 
673 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  48.07 
 
 
965 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
397 aa  206  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 
561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
656 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.01 
 
 
691 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.12 
 
 
730 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 
625 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
554 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 
675 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 
702 aa  199  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
644 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
714 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.47 
 
 
730 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
741 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
670 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 
565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 
565 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
572 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
655 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
687 aa  197  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
656 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
688 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 
567 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 
541 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
566 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
561 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
688 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
688 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
566 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
561 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 
674 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 
535 aa  194  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 
563 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  37.21 
 
 
698 aa  193  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
567 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
674 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
688 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
563 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.48 
 
 
676 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
560 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.96 
 
 
574 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>