More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2197 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
522 aa  1021    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
545 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 
539 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  49.88 
 
 
518 aa  316  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  53.62 
 
 
540 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  56.15 
 
 
538 aa  301  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 
533 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
542 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  46.17 
 
 
562 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  52.48 
 
 
543 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  55.38 
 
 
540 aa  283  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.68 
 
 
545 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.57 
 
 
538 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 
540 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 
544 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  50.15 
 
 
347 aa  279  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
538 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  45.67 
 
 
531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  41.76 
 
 
533 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.73 
 
 
538 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
394 aa  269  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 
528 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 
530 aa  266  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  47.9 
 
 
407 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.13 
 
 
547 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 
535 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
532 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.12 
 
 
904 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.55 
 
 
623 aa  263  8e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.6 
 
 
546 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.19 
 
 
542 aa  262  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
536 aa  259  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.98 
 
 
523 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.36 
 
 
1150 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 
535 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  53.69 
 
 
540 aa  246  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 
529 aa  244  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 
524 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
702 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.1 
 
 
530 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.27 
 
 
531 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 
858 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 
545 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 
550 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
544 aa  230  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  46.48 
 
 
583 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 
526 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 
535 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
715 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.95 
 
 
533 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 
397 aa  213  9e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 
657 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 
560 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 
573 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  41.59 
 
 
515 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
730 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
554 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
686 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 
566 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 
493 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 
656 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
563 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 
562 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
561 aa  193  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 
965 aa  193  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 
566 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.49 
 
 
650 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 
567 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
563 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
563 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 
656 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 
730 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  35.41 
 
 
565 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
573 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
538 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 
698 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
656 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
563 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 
741 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 
557 aa  187  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
625 aa  187  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
535 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 
712 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.87 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  35.97 
 
 
697 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 
731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  44.27 
 
 
691 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 
562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 
563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 
561 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
655 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
670 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 
540 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.98 
 
 
574 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>