More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4361 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  69.44 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  62.25 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  51.36 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  322  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  43.75 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  44.82 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  45.3 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.36 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.97 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.07 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.77 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.97 
 
 		 332 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.43 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.04 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.15 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  34.43 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.74 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  31.83 
 
 		 340 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  33.77 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.23 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  31.79 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.65 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.33 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.33 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  35.37 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.65 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.07 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.44 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.44 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  34.56 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.27 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  34.86 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  33.56 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  36.2 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  35.87 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  34.09 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  35.97 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.14 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.25 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  35.59 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  35.96 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  33.78 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  34.65 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  31.89 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  34.88 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.58 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  33.77 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  35.91 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  35.69 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  31.48 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  34.32 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.29 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.82 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  34.45 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35.16 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  34.77 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  33.01 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  35.03 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.07 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  34.22 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  34.42 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  32.14 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  34.22 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.68 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.11 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.11 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  32.05 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  31.15 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  33.44 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.43 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  34.33 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  36.56 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.63 
 
 		 333 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  34.44 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  32.4 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  31.15 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  32.52 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  36.56 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  33.76 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.97 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  34.47 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  34.99 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  34.13 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2124  hypothetical protein  33.67 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  32.11 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  32.78 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  32.29 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  34.23 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  31.8 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  33.22 
 
 		 327 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>