More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0356 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  70.12 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  65.55 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  51.54 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  47.09 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  46.23 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  44.37 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  42.43 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  44.81 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.25 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.53 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  35.48 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  35.88 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.26 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  34.7 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.85 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.55 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  38.31 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  35.87 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.07 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  35.62 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.98 
 
 		 353 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  32.2 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  39.54 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.78 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  39.54 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.78 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  32.29 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.71 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  34.22 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.75 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.19 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  32.79 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  32.44 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.67 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.65 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  34.53 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.65 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  36.03 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  32.39 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  33.44 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.92 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  33.95 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  35.31 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  34.95 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  32.32 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  32.57 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  34.28 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  36.69 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.79 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.67 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  33.56 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.46 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  35.58 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  34.98 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  33.54 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  32.8 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.14 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  32.8 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  32.09 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  35.65 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.4 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  33.65 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  37.32 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  33.99 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  35.35 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  32.34 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  33.23 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.97 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  32.93 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  36.88 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.1 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  32.46 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  35 
 
 		 330 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  34.27 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  37.26 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.12 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  30.25 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  33.64 
 
 		 356 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 347 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.4 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.53 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  31.68 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  36.48 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  32.05 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  32.79 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  32.78 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  35.53 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  33.65 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  33.55 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  34.46 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>