More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3439 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  76.56 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  53.97 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  49.35 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  50.49 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  46.42 
 
 		 327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  48.16 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  48.16 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  49.5 
 
 		 336 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.89 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.92 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  37.21 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  39.05 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.1 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.2 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.88 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.2 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  34.1 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  35.99 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2276  hypothetical protein  38.35 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  35.74 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.49 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  35.55 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  35.43 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  35.86 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.44 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  34.67 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.03 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  33.44 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  33.23 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  35.45 
 
 		 338 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.1 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  35.79 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  37.79 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  36.68 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  35.48 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  35.48 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  35.92 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  34.88 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  36.96 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.67 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.53 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.88 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  32.46 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  35.42 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.21 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  35.23 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.91 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  33.85 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.69 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.9 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.36 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  36.09 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.15 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.92 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  36.75 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  33.65 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  31.56 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  35.08 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  34.75 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  34.75 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  38.11 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  36.63 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.75 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  34.9 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  34.1 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  33.67 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  35.1 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  34.1 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  31.87 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  36.08 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  36.18 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33.74 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33.74 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  36.54 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  34 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  34.56 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  35.31 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  36.21 
 
 		 330 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  33.89 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  32.63 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  33.89 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  32.5 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>