More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3148 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  73.58 
 
 		 329 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  66.56 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  49.5 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  48.02 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  45.48 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  42.73 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  41.99 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  43.71 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.1 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.06 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  34.25 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  35.45 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  37.23 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  32.11 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  32.11 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.37 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.96 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.67 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  36.54 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.59 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.1 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.31 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.11 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  33.56 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.44 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  33.75 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  32.05 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  34.31 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33.03 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  35.55 
 
 		 339 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2932  hypothetical protein  32.32 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  36.62 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  35.28 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.62 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.73 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  37.17 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  34.11 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  32.01 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  35.11 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  33.54 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.24 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  35.47 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.45 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.08 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.87 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  33.95 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  32.26 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  34.43 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  35.58 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.7 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.8 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.78 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  40.46 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  35.12 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  32.33 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  33.44 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.2 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.79 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.77 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.77 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  31.83 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  32.52 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  33.11 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  31.77 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  35.04 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  31.49 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  32.78 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  30.46 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.5 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  34.04 
 
 		 323 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  34.83 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  33.11 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  36.84 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  31.29 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  31.83 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  36.84 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  34.29 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  33.11 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  35.19 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  31.83 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  32.42 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  34.41 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  33.13 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  34.43 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.67 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  34.56 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.06 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>