More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3699 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  65.55 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  66.45 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  46.81 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  45.48 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  45.21 
 
 		 332 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  43.5 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  45.36 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  45.45 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  33.02 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.66 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  33.01 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.64 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  31.91 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.03 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  32.1 
 
 		 352 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  33.62 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.52 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.27 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  31.56 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  30.96 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  35.42 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  31.78 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  37.15 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  36.43 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  33.53 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.55 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  31.02 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.63 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  32.91 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.46 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  32.9 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.33 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.13 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  32.94 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  33.89 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  31.31 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  35.43 
 
 		 327 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  31.58 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  32.44 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  34.32 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  33.67 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  34.3 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  30.62 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  30.33 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  33.54 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  33.66 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  32.67 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.32 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  31.4 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  32 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  32.4 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.47 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  33.02 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  31.68 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  34.67 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  35.92 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  31.48 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  32.34 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  33.57 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.67 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  32.48 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.67 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  32.45 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  31.35 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.02 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  31.56 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  33.63 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  30.43 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  31 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  31.8 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  33.56 
 
 		 322 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  30.43 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  31.44 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  31.78 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  32.11 
 
 		 325 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  32.89 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  32.04 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  33.64 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.73 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  30.51 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3320  hypothetical protein  36.97 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  32.01 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5654  hypothetical protein  33.23 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  31.83 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  31.14 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.36 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.77 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  31.67 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  31.9 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  34.21 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  30.12 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  29.82 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>